医療費控除｜自動入力でも漏れるものチェックリスト（交通費・市販薬・自由診療）【2026】

マイナポータル連携の医療費通知（自動入力）は強い。
でも、これだけで「医療費控除が完成」とは限りません。

理由はシンプル👇
医療費通知に「含まれない費用」があるからです（あとで追加入力できます）。

1) 申告が必要/不要：まず分岐 ✅

✅ 医療費控除を使うなら、基本的に確定申告が必要
⚠️ 所得税の申告をしない場合でも、住民税申告が必要になる自治体があります（論点は #04 へ）

2) 所得区分の考え方（この記事は“控除”側）

医療費控除は「所得区分（事業/雑/一時/申告分離）」とは別レーンの控除です。
ただし、e-Tax入力では“収入側”も必要なので、区分がまだなら先に整理しておくと詰まりません。

3) 売上の集計手順（どの明細を使うか）※最小だけ

✅ 配達：アプリ明細→入金照合（#03）
✅ ポイ活：ポイント通帳＋交換履歴＋入金（#07）
✅ FX：年間取引報告書（#10）

4) まず結論：医療費控除の計算で“差し引くもの”がある

医療費控除は、支払った医療費から保険金などで補てんされる金額を差し引いて計算します。
高額療養費などは「医療費そのもの」ではなく、差し引く側（補てん）です。ここを忘れるとズレます。

5) 自動入力でも漏れるものチェックリスト ✅（追加入力が必要）

✅ A. 医療費通知に「含まれない」代表例（そのまま漏れる）

✅ ドラッグストアで買った薬（医療費通知の対象外）
✅ 高額療養費（後日支給される補てん）
✅ 療養費（立替払い、治療用装具など）
✅ はり・きゅう／あんま・マッサージ・指圧（医療費通知に含まれないケース）
✅ 整骨院・接骨院（柔道整復）（医療費通知に含まれないケース）
✅ 保険適用外（自由診療／差額ベッド代など）

✅ B. “控除対象になり得るのに”通知に入らないことがあるもの（見落としやすい）

✅ 通院の交通費（電車・バス等）（領収書がないことが多いのでメモが重要）
✅ タクシー代（原則NG寄りだが、急を要する等の条件で対象になり得る）
✅ 医療用器具（コルセット等）（必要なものは対象になり得る）

6) “追加入力”の作業テンプレ（e-Taxで詰まらない）

マイナポータル取得後でも、通知にない医療費は追加入力できます。

✅ マイナポータル連携で医療費通知を取得（自動入力）
✅ その後に「通知にない医療費」を追加入力（自由診療・交通費・市販薬など）
✅ 補てん（高額療養費、入院給付金など）を入力して差し引く

7) 経費：落ちる/落ちない（この記事は“医療費”の整理）

医療費控除は「経費」ではなく「控除」です。
ただ、家計側の保存ルールは経費と同じで、証拠が命です。

8) 按分のやり方（この記事の範囲では基本なし）

医療費控除そのものは按分しません。
（家族分をまとめて申告できる等の論点はあるが、これは“按分”ではありません）

9) 証拠の残し方（ここが本題）

✅ 医療費通知を使う場合の基本

✅ 医療費控除は「明細書」の提出が基本
✅ 領収書は原則5年保存（医療費通知を添付する場合は取扱いが変わる）

✅ “漏れ分”の保存（これが勝ち筋）

✅ 市販薬：レシート（品名が出ない場合は商品名メモ）
✅ 交通費：ノート/メモ（いつ・誰が・どこへ・いくら）
✅ 自由診療：領収書（内訳が分かるもの）
✅ 補てん：高額療養費の支給決定通知、保険会社の支給明細など

月1保存フォルダ（これで毎年ラク）

/確定申告/2025/医療費控除/
  /01_医療費通知（自動入力）/
    - 医療費通知データ（取得控え）
  /02_漏れ分（追加入力）/
    - 市販薬_レシート.jpg
    - 交通費メモ.txt
    - 自由診療_領収書.pdf
  /03_補てん（差し引く）/
    - 高額療養費_通知.pdf
    - 入院給付金_明細.pdf
  /04_提出控え/
    - 申告書控え.pdf
    - 医療費控除の明細書.pdf